『机动战士高达00』第二季是以第一季过去四年之后的世界为故事背景.成长了的刹那·F·清英驾驶着EXIA的后续机GUNDAM 00再次降临到世界的舞台.第二季的制作阵容为第一季的staff再次集结,共同描画刹那等人的又一次活跃. 另据监督的访谈,明确提出了这样的文字—“洛克昂在第一季的戏中已经死了,不会复活,我能说的就到此为止了.若各位对此十分在意,或许再看遍第一,重新评估一下比较好.”三木将可能成为洛克昂的弟弟而继续存在,而刹那将会成为新的领队,流浪在世界各地,以自己的意识行动着… 剧情:西历2312年,天人和国连军的最终决战之后的4年.建立了地球联邦政府的人类,为了更进一部整合国家和人类的意.志而成立了独立治安维持部队A-LOWS,实际上该组织的目的是借统一之名对反政府组织、主义、思想等的非人道主义的武力镇.压,而以成为宇宙技术者为目标的沙慈也被卷进了联邦政府的改革中.另一方面，在4年前的最终决战中幸存下来的刹那正凝视着这个曾由天人促进改革的世界,而映在眼帘的却是A-LOWS造出的漫溢着武力镇.压的所谓“和平”,还有不断被扭曲的现实,决定再次战斗,足以改变世界的强大力量—高达.成长了的刹那驾驶新机体OO高达再次出现.摆在“天人”和刹那面前的新战争是..?